2016高新技術企業認定管理工作指引與2008版有很大的改變，評分更細致，從評分標準的改變：
指標滿分為100分，綜合得分達到70分以上（不含70分）為符合認定要求。
1、知識產權（30分）的評分變化：
（1）技術的先進程度
A.高（7-8分）
B.較高（5-6分）
C.一般（3-4分）
D.較低（1-2分）
E.無（0分）
【解讀】注重考查技術的含金量，專家的主觀判斷性強，扣分也會是***嚴重的。
（2）對主要產品（服務）在技術上發揮核心支持作用
A.高（7-8分）
B.較高（5-6分）
C.一般（3-4分）
D.較低（1-2分）
E.無（0分）
【解讀】60%高新收入，是由知識產權支撐的，知識產權轉化的產品為主營業務，可以得A分。
（3）知識產權數量
A.1項及以上（Ⅰ類）（7-8分）
B.5項及以上（Ⅱ類）（5-6分）
C.3～4項（Ⅱ類）（3-4分）
D.1～2項（Ⅱ類）（1-2分）
E.0項（0分）
【解讀】發明專利、植物新品種、新藥中藥保護品種和集成電路布圖設計為Ⅰ類,其他形式的知識產權為Ⅱ類，通常情況下都會有6項，加重發明專利的權重。
（4）知識產權獲得方式
A.自主研發（≤6分）
B.受讓、受贈和并購等（≤3分）
【解讀】鼓勵自主研發。
（5）企業制定國家標準、行業標準、檢測方法、技術規范的情況（此項為加分項，加分后“知識產權”總分不超過30分。相關標準、方法和規范須經國家有關部門認證認可。）
A.是（1-2分）
B.否（0分）
【解讀】此項針對例如知識產權管理認證體系，這樣的認證項目。認定條件里針對知識產權還有規定，1，合作開發有明確的規定：在申請高新技術企業及高新技術企業資格存續期內，知識產權有多個權屬人時，只能由一個權屬人在申請時使用。2，Ⅱ類知識產權在申請高新技術企業時，僅限使用一次。
2、研究開發組織管理水平（≤30分）的評分變化，以前是20分，現在變為30分，此項成為企業能否通過高新的關鍵。
（1）定制了企業研究開發組織管理制度，建立了研發投入核算體系，編制了研發費用輔助帳；（≤8分）
【解讀】提供研發管理制度，核算體系，研發費用輔助賬。
（2）設立了內部科技技術研究開發機構并具備相應的科研條件，與國內外研究開發機構開展多種形式的產學研合作；（≤7分）
【解讀】提供研發設備清單，產學研協議。
（3）建立了科技成果轉化的組織實施與激勵獎勵制度，建立開放式的創新創業平臺；（≤6分）
【解讀】鼓勵研發成果轉化，從研發到銷售的激勵制度，鼓勵企業員工，自主創新，自主創業。
（4）建立了科技人員的培養進修、職工技能培訓、優秀人才引進，以及人才績效評價獎勵制度；（≤6分）
【解讀】提供一份針對員工成長的績效評價獎勵制度。
（5）開展面向社會公眾的科技學技術普及活動。（≤3分）
【解讀】提供活動照片
3、科技成果轉化能力（≤20分），以前是30分。
A.轉化能力強，6項以上（16-20分）
B.轉化能力較強，4-5項（11-15分）
C.轉化能力一般，2-3項（6-10分）
D.轉化能力較弱，0-1項（0-5分）
【解讀】1，數量來說，年平均數以前是5項以上，現在是6項以上，三年的話是是18項。2，同一科技成果分別在國內外轉化的，或轉化為多個產品、服務、工藝、樣品、樣機等的，只計為一項。
4.企業成長性(≤20分)
由財務專家選取企業凈資產增長率、銷售收入增長率和年平均利潤率等指標對企業成長性進行評估。企業實際經營期不滿三年都按照實際經營時間計算。計算方法如下：
（1）凈資產增長率（9分）
凈資產增長率=1/2×(第二年末凈資產÷***年末凈資產＋第三年末凈資產÷第二年末凈資產）－1凈資產=資產總額－負債總額
資產總額、負債總額應以具有資質的中介機構鑒證的企業財務報表期末數為準。
【解讀】請注意，以前是總資產增長率，現在是凈資產增長率
（2）銷售收入增長率（7分）
銷售收入增長率=1/2×(第二年銷售收入÷***年銷售收入＋第三年銷售收入÷第二年銷售收入）－1
企業凈資產增長率或銷售收入增長率為負的，按0分計算。***年凈資產或銷售收入為0的，按兩年計算；第二年凈資產或銷售收入為0的，按0分計算。
（3）年平均利潤率（4分）
年平均利潤率=近三個會計年度的利潤總額÷同期銷售收入總額×100%
以上三個指標，分別對照下表評價檔次（ABCDE）得出分值，三項得分相加計算出企業成長性指標綜合得分。
